ATAC analysis

Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing (ATAC-seq) 은 염색질 접근성을 평가하기 위해 사용되는 분자생물학 기술입니다.

시퀀싱 어댑터를 유전체의 열려있는 영역에 삽입하는 활성 돌연변이 Tn5 transposase로 염색질을 조사하여 접근 가능한 DNA영역을 식별합니다.

Tn5 transposase 돌연변이는 tagmentation 과정을 통해 긴 DNA를 잘라냅니다.
그 후, 태그가 붙은 DNA 단편을 정제, PCR증폭, 시퀀싱을 수행합니다.
시퀀싱 read로 유전체의 접근 가능한 영역 유추가 가능하고 transcription factor 결합 부위 및 nucleosome위치에 대한 영역을 맵핑하는데 사용할 수 있습니다.

* 자세한 실험 샘플 준비 요건은 서비스 의뢰 시 연구자와 상의 후 결정 가능합니다.